当今世界性的江、河、湖、海、水库、池塘等地表水污染严重，富营养化造成蓝绿藻类滋生的水面随处可见。由于水质的污染水中的寄生虫、病原菌大量繁衍，造成了鱼虾蟹等水生动物病害频发，不得不使用大量的孔雀石绿、苏丹红、以及各式各样的抗寄生虫药物、抗病源微生物药物等进行防治。因此，造成了鱼虾蟹等水产品农残、药残、化残等残毒严重超标。到目前为止，还没有找到科学的办法解决。
       造成地表水污染的主要原因有农业、种植业多年来使用化学肥料、化学农药和有毒化学物质造成的富营养化外，还有多年来，水下的污泥沉积造成的内源污染。另外，还有污水、废水的排放等多种因素。因此，地表水净化必须从多方面综合治理才能有效。三安模式净化地表水的主要方法如下：
一、面源的净化
       面源污染系指农业生产所使用化肥、未经除臭、解毒处理的畜禽粪便、人粪尿、厩肥，以及各种农家肥、农药等物质。这些物质在雨水或灌溉水的流动中进入水体，造成水体内氮磷营养富集，以及寄生虫和病源微生物滋生。三安模式首先使用三安生物肥料、三安植物保护剂，以及经过三安生物除臭、解毒、增效（使用畜禽粪便、人粪尿、厩肥，以及各种农家肥为原料）制成的三安生物有机肥料。不再施用化学肥料和未经除臭、解毒、增效处理的畜禽粪便、人粪尿、厩肥，以及各种农家肥。使用三安生物植物保护剂不再施用化学农药等，控制了面源污染。
二、点源污染的处理
       按照“第一部分效益化城市污水、废水的三安模式”所阐述的方法实施即可。
三、蓝绿藻的快速絮凝
       使用三安生物藻类絮凝剂，对水体中的蓝绿藻迅速絮凝，沉降到水底后，在有内源降解微生物逐步将降，达到控制水体蓝绿藻滋生的目的。
四、水体富营养化的快速消除
       使用三安生物氮磷转化剂，水体中无机氮磷迅速转化为细胞类的有机氮。大量三安系列微生物细胞为水中的甲壳藻、长腿藻、红线虫等低等动物提供了最适宜的食物，造成水生低等动物的大量繁殖。这些水生低等动物恰是鱼虾蟹等水生动物的活性饲料，然后，再放养鱼虾蟹等水生动物，即通过养殖鱼虾蟹等水生动物建立起水生态自净化系统。达到消除富营养化的目的。
五、内源污染物的快速降解
       内源污染指的是水下积累的底泥。底泥中含有大量的有机物质是造成水体污染的因素之一。三安模式采用三安底泥降解剂（含有有机质降解系列微生物），均匀撒在水面自动沉降至水底，快速分解底泥中的有机质，以达到消除内源污染的目的。
地表水净化与综合治理示意图

六、生态水产养殖的三安模式
       通过以上三安模式对地表水的综合净化，获得了清洁生态水源。这种模式可以用在大面积的河流、湖泊、海湾、水库、池塘，以及水产养殖领域。为了更好的保持水生态的长期净化，必须在净化的同时养殖鱼虾蟹等水生动物。在水净化过程中三安系列微生物大量繁衍，为水中的甲壳藻、长腿藻及红线虫等低等动物提供了活性饲料。刺激了甲壳藻、长腿藻及红线虫等低等动物大量繁衍。甲壳藻、长腿藻及红线虫是鱼虾蟹等水生动物最佳的活性饲料，刺激了鱼虾蟹等水生动物的生长。大量鱼虾蟹的繁衍为市场提供了洁净、安全，符合《三安食品质量安全标准》的水产品。因此，可以通过净化的水生态环境获得高效益化的水产养殖业。